在杭州辦理三類醫療器械經營許可證，一般需要按照以下流程進行：

1. 準備材料：首先，準備好申請三類醫療器械經營許可證所需的材料，包括公司營業執照、法人代表身份證、經營場所租賃合同、醫療器械經營許可申請表等。

2. 咨詢了解政策法規：在準備材料的同時，建議咨詢當地相關部門或專業機構，了解詳細的政策法規和辦理流程，確保符合法規要求。

3. 遞交申請：將準備好的材料遞交給當地衛生健康部門或藥品監督管理局，提交三類醫療器械經營許可證的申請。

4. 材料審核：相關部門會對提交的申請材料進行審核，確保符合規定的要求和標準。

5. 現場核查：部分地區可能需要進行現場核查，以確認經營場所符合要求，設施設備齊全。

6. 審批發證：經過審核和核查后，相關部門會審批通過并發放三類醫療器械經營許可證。

以上是辦理三類醫療器械經營許可證的一般流程，具體的辦理流程和要求可能會因地區和政策法規而有所不同，請在辦理前詳細了解當地要求。